Fakturace pro e-shopy: Povinnosti, DPH a automatizace v roce 2026

E-shop a fakturace – základní povinnosti

Provoz e-shopu přináší řadu specifických povinností v oblasti fakturace a DPH. Bez ohledu na to, zda prodáváte oblečení, elektroniku nebo digitální produkty, musíte znát pravidla pro vystavování daňových dokladů a správné odvedení daně z přidané hodnoty.

Základní pravidlo zní: plátce DPH je povinen vystavit daňový doklad ke každé uskutečněné transakci vůči jinému plátci DPH. Vůči koncovým zákazníkům (neplátcům) tato povinnost není tak striktní – záleží na konkrétní situaci.

Účtenka vs faktura – kdy co vydávat

Mnoho provozovatelů e-shopů si klade otázku: musím zákazníkovi posílat fakturu, nebo stačí účtenka?

• Prodej koncovým zákazníkům (B2C) – Zákon o DPH ukládá povinnost vystavit daňový doklad pouze na výslovnou žádost zákazníka. Jinak postačí pokladní doklad (účtenka) nebo potvrzení objednávky. Nicméně zákon o ochraně spotřebitele ukládá povinnost vydat doklad o koupi vždy.
• Prodej firmám (B2B) – Daňový doklad musíte vystavit vždy, pokud je odběratel plátce DPH. Lhůta je 15 dní od uskutečnění zdanitelného plnění nebo od přijetí zálohy.

V praxi většina e-shopů zasílá fakturu automaticky všem zákazníkům – jde o profesionální přístup, který předchází zbytečným reklamacím a sporům.

OSS režim – prodej do zemí EU

Pokud váš e-shop prodává zboží nebo digitální služby zákazníkům v jiných státech EU, narazíte na speciální pravidla DPH. Od roku 2021 platí v EU One Stop Shop (OSS) – jednotné kontaktní místo pro odvod DPH z přeshraničního prodeje.

Jak OSS funguje:

1. Pokud vaše přeshraniční prodeje do EU přesáhnou 10 000 EUR ročně (nebo ekvivalent v CZK – cca 250 000 Kč), musíte odvádět DPH podle sazby platné v zemi zákazníka, nikoli v ČR.
2. Registrací do OSS (v ČR přes daňový portál finanční správy) podáváte jedno souhrnné přiznání za všechny státy EU.
3. Bez OSS byste se museli registrovat k DPH v každé zemi EU zvlášť – to by znamenalo enormní administrativní zátěž.

OSS se vztahuje na:

• Prodej zboží na dálku (zásilkový prodej) do jiných států EU
• Elektronicky poskytované služby (software, digitální obsah, streamingové služby)
• Telekomunikační a rozhlasové služby

Sazby DPH v EU – na co si dát pozor

Každý stát EU má vlastní sazby DPH. Při prodeji do Německa uplatníte německou sazbu, při prodeji do Maďarska maďarskou. Tyto sazby se liší a mění. Například:

• Německo: základní sazba 19 %
• Maďarsko: základní sazba 27 %
• Polsko: základní sazba 23 %
• Slovensko: základní sazba 23 %

Evidovat správnou sazbu pro každou objednávku z EU ručně je prakticky nereálné – proto je automatizace klíčová.

Automatizace fakturace pro e-shopy

E-shopy generují desítky až stovky objednávek denně. Ruční vystavování faktur je v takovém prostředí nepřijatelné. Moderní fakturační nástroje nabízejí:

• API napojení na e-shopové platformy (Shoptet, WooCommerce, Shopify a další) – faktura se vystaví automaticky po zaplacení objednávky.
• Automatické odesílání faktury zákazníkovi e-mailem.
• Správnou aplikaci sazby DPH podle země zákazníka.
• Export dat pro OSS přiznání.
• Archivaci faktur dle zákonných lhůt (minimálně 10 let).

Archivace a uchovávání daňových dokladů

Zákon o DPH ukládá povinnost uchovávat daňové doklady 10 let od konce zdaňovacího období, ve kterém se plnění uskutečnilo. Pro e-shopy to znamená, že všechny faktury – včetně těch vystavených automaticky – musí být bezpečně uloženy a přístupné pro případnou daňovou kontrolu.

Elektronická archivace je plně akceptována za podmínky, že jsou doklady čitelné, neměnné a přístupné (§ 35a ZDPH). Cloudová fakturační řešení tuto povinnost automaticky plní.

Digitální obsah a DPH – zvláštní pravidla

Pokud prodáváte digitální produkty (e-booky, software, online kurzy), platí, že místo plnění je vždy v zemi zákazníka, bez ohledu na výši obratu. Limit 10 000 EUR se na digitální obsah nevztahuje – DPH dle země zákazníka odvádíte od první transakce.

Registrace do OSS je proto pro prodejce digitálního obsahu prakticky nutností od prvního prodeje do zahraničí.

Zautomatizujte fakturaci svého e-shopu

S Fakturuj.si za pouhých 50 Kč měsíčně propojíte svůj e-shop s fakturačním systémem přes API a vystavíte faktury automaticky – se správnou sazbou DPH, ve správný čas, se zákonnou archivací. Ušetříte hodiny administrativy a minimalizujete riziko chyb. Vyzkoušejte Fakturuj.si zdarma a bez závazků.